战斗前：
化为人形的的7原种侵入了ORBITBASE内部！万份危机的时刻，αnumbers居然出现在ORBITBASE的大门口！果然，GATE是有意将αnumbers传送到这里来的么？

ORBITBASE内部
在αnumbers和GGG的合力战斗下，肝脏原种被消灭，其他原种被逼出。但逃出ORBITBASE的6原种居然在月球表面合体！
月球守军全灭，在最后一刻仍将所知的情报传达了回来。随着J-ARK和αnumbers的登场，对原种决战正式打响！
大河：“各机听好！那原种是6原种合体而成的东西…。它的战斗力几乎无可限量！但是我们、一定要消灭那个恐怖的敌人！为了居住在我们母星上的所有生物！”
凯：“上吧、大家！为了赌上自己的生命让我们回到地球的超龙神！为了让我们能够赶到这里而牺牲性命的战士们！这场战斗，绝对要赢！！”

战术：
战斗开始后ジェイアーク就会单身冲到合体原种面前，最好让其每回合都使用铁壁。
敌人机体名称为“EI-XX”的这一类机体的小队击破后都可以获得大量资金，建议使用“幸运”精神击破这几个小队。
合体原种都有防壁技能，武器威力低于4000的几乎不能对其造成伤害，所以在攻击时不要选择小队攻击，选择单体攻击即可。
本关结束后获得4个强化芯片——ミノフスキークラフト、スラスターモジュール、防尘装置、スクリューモジュール。

战斗中：
“合体原种啊，给我变成光吧！！！”
在勇者王的金色巨锤下，合体原种终于被打倒了。虽然最后净化时有两个原种逃离，但暂时原种们应该会安静一段时间了。

战斗后：
ORBITBASE
伊卡洛斯基地传来的情报表明泽·巴尔玛利帝国监察军把舰队的据点移到了火星。虽然没有明显的战斗意图，而且离我方基地也非常之远；但冈长官还是指挥驻留军进入了临战态势。大田夫妇则决定回到伊卡洛斯基地。毕竟，和外宇宙强敌的对抗才刚刚开始。

？？？　银河系 中心部
？？？A：“三重连太阳系、紫星。智慧生命体生出应激的波动、为了消灭负面思念而诞生的宗达金属…”
？？？B：“………”
？？？A：“但是、却由于独自的程序而开始失控。然后、无数的星球就像冒出病原体的细胞那样被毁灭了。”
？？？C：“………”
？？？A：“步向灭亡的绿与红之星…然而、拥有战胜病原体力量的抗体却在那里却诞生了。”
？？？C：“说的是那些少年们吧？”
？？？A：“没错。然后、那两个抗体去到了蓝星，作为守护那叫做宇宙的的庞大生命的疫苗…”
？？？C:“…那么、听一下边境银河太阳系方面相关的报告吧”
？？？B：“除了边境银河方面监察军第1舰队由于事故而把处点移至第4惑星以外…其它都在顺利进行。”
？？？A：“哼嗯…”
？？？B：“一定会将殿下所期待的‘被遴选者’引导到此处”
？？？A：“但是、差不多两年前在你的旗下出现过反叛者的吧？名字叫…什么来着…”
？？？B：“尤泽斯·格茨…”
？？？A：“对、就是那个名字。格茨家虽然有很多优秀的人才，但常常都会有过分相信自己力量的人出现让人很困扰呢。”
？？？B：“尤泽斯是接触CROSS GATE并想要控制它的蠢货”
？？？A：“一点不错”
？？？B：“因此、他受到了报应…消失在因果地平线的彼端”
？？？A:“不过、多亏了他才弄明白了地球这个惑星的事情。关于这点还是要予以嘉奖的” 
？？？B：“这对尤泽斯那种人真是太过誉了…”
？？？A：“只是饯别而已啦。对那个被无限力吞噬、并毁灭掉的那个可怜的木头人偶说的呢…”
？？？B：“………”
？？？A：“好了、从现在开始会很忙哦。一定要从巨大的灾难中保护我们的巴尔玛星呢”
？？？C：“遵旨”
？？？A：“一切皆为创世神兹菲尔德保佑。哼哼…哼哼哼…嗯哼哼哼…”

机界最强7原种败退了。
但是、地球圈战乱完全没有终止的迹象。
成功压制欧洲和非洲的ZAFT，预定不日就会压向联邦军总部所在的阿拉斯加基地。
还有，虽然已从大气层内撤出，却开始从月球前线基地向各地从处部队的星间联合。
以及、在那遥远众星的彼端…。
从地球出发的超长距离移民船队中的一个终于到达的惑星A-7，通称索罗星……。
现今，超越人类所知的强大力量开始蠢动。

银河系 欧米咖星团 索罗星
索罗星挖掘出的遗迹复原而成的巨大车辆，追赶名为卡拉拉的女性而发起攻击的巴夫·古兰士兵。克斯莫一行五人乘上了三辆巨车，想要开动的时候伊丁印记突然反应，三两巨车合体成为了传说中的巨神伊丁！

？？？　银河系 中心部
？？？A：“…听到了鼓动。对、无限力…既为α、亦是ω的力量…呢。神鸣之门、CROSS GATE的出现…。这里经过数年的破坏神们的急剧增殖…。莫不是…”
？？？B：“那是…？”
？？？A：“啊啊、最终试炼之时临近了”
？？？B：“最终试炼…”
？？？A：“嗯。这个银河…不、宇宙将会迎来终结”
？？？B：“那么、尽快制止无限力的源头，让它成为我们…”
？？？A：“得到无限力？哈哈哈、说傻话可不行呦”
？？？B：“……！”
？？？A：“那不是能得到的东西。…是应当毁灭之物。”
？？？B：“不那样的话、我们就会被消灭…吗？”
？？？A：“没错。不那么做的话，我们就无法从那死与新生的轮回中脱出。”
？？？B：“………”
？？？A：“加快计划，西瓦·格茨。为了将被无限力指引的人们的意思…同那些仆役们从这广阔的世界中抹消…。将切断死与新生之轮回的利剑呈与我面前…”
？？？B：“…遵旨…”

被称为伊丁的巨神和异星人巴夫·古兰……
响彻幻灭银河的战钟唤来了新的战云。
作为超长距离移民船团中的一支、MACROSS7船队旗舰的MACROSS7……
就像是和巨神的觉醒相呼应一样，他们也到达了索罗星。

银河系 欧米咖星团 MACROSS7
麦克西里米安·吉纳斯作为MACROSS7的船长，同美嘉洛德船队分开已有35年…。新西历226年的现在，他们终于收到了来自地球同胞的通信，邀请MACROSS7船队前去他们已经发现并居住两年的惑星A-7。而现在，久违的绿色大地即将展现于麦克斯船队舰长的眼前。

索罗星 第6文明人遗迹
贝斯想立刻用伊丁来对抗突然袭来的异星人，而谢莉尔则让克斯莫他们将伊丁运到第2发掘现场。而森林中，贝斯和卡拉拉相识了。

欧米咖星团 索罗星附近宙区域 伽塔曼·藏 舰桥
吉杰决定自己去迎接德巴总司令的女儿卡拉拉，达米德的话则令人非常不愉快。