过场剧情

覇道邸/地下基地机库

　　九郎责怪自己的犹豫避战害死了アル，于是他决定自己去消灭アンチクロス，但是大家告诫他为了憎恨而战最终会毁了自己。

覇道邸/接待室

　　九郎被大家劝了回去，アル将自己的信念托付给了九郎，这就和リチャード一样，リチャード在最后也将悲伤和痛苦教给了サヤ。不过因为现在可以完全同期临界，所以时空跳跃不再对アーニー的身体造成损害。オルフェス的空间跳跃是在一瞬间将这个世界存在的相关事物消灭，所以会大量消耗操纵者的生命。现在サヤ创造了新的意志，オルフェス也被赋予了新的生命，大家提议要给这台机体起一个新名字。

覇道邸/地下司令室

　　フロンティア船团方面请求我方前去消灭バジュラ的巢穴，已经发现了バジュラ数百千米级的要塞，这个要塞正徐徐前往地球。不过在这里上空的邪神也不能不管，部队再度被分成了两部分，アーニー又要做出选择。（选择：バジュラの掃討作戦に参加する/アーカムシティの防衛に残る）

覇道邸/廊下

　　アーニー向周瑜讨教兵法，他想接替リチャード的战术指挥。周瑜答应了，不过他的身体已经快不行了……

フロンティア船团/总统府

　　对于UX出手来对付バジュラ，ハワード有些担心，毕竟对手是母巢级别的敌人，但是三島认为为了获得フォールド晶体这也是有价值的，フォールド晶体只在バジュラ体内存在，同时这也将是ランカ的初次登台，而シェリル也就没有用处了。

アプリリウス1/议长室

　　ラクス正在着手修复レクイエム，她和ルーベンス正在推进计划。为了获得和平就必须再次使用武力，キラ也已经准备上路，这时候アスラン过来主动要求同往。

战前剧情

フロンティア船团/总统办公室

　　我方看到バジュラ的要塞后也大吃一惊，フロンティア船团所在的宇宙在半个世纪前就曾被它们给破坏过，现在推测バジュラ也是追着フロンティア船团来到了这个世界。要对付这么大的敌人，单靠UX还是不够的，一方面SMS小队现有武装要加装反应武器，另外也需要联邦军的援助。UX的目标是要塞中心反应炉，破坏掉那个的话就可以解决掉要塞了。为从大批バジュラ中冲进去，ルカ的RVF-25加装了特殊背包，バジュラ是使用フォールド波进行通讯的，如果搅乱这个波动的话就可以干扰它们。此时联邦军的デカルト也来到这里，他就是单机摧毁废弃木星调查船的人，没想到他也是变革者，但是他和刹那的理念完全不同。

フロンティア船团/宾馆

　　シェリル的V型感染症只能通过摘除声带来治疗，但是她无论如何都不能接受不能唱歌的后果。此时ナイア突然出现在这里，保镖ブレラ向她开枪却丝毫不能伤到她。ナイア暗示グレイス是知道怎么让シェリル能够延续自己的演艺生命的，这时候グレイス才不得不说出移植了对V型感染症免疫的人的血液和器官是唯一的两全方法，但这样必定会夺去对方的性命。ナイア非常想看到シェリル做出选择，突然一阵风刮过她就消失了。现在唯一拥有对V型感染症免疫的人只有一个，那就是ランカ。

フロンティア船团/ランカ的乐房

　　アルト和其他人都过来为ランカ的演唱会加油，道明寺还带来了降矢的贺信，此外刹那表示之前就对ランカ有兴趣，刹那是发现ランカ的歌似乎可以影响那些家伙们。ルカ的机体上加装了可以现场播放ランカ演唱会歌声的装置，其中使用了フォールド晶体，这种物质似乎可以传达人的感情，这就和オデュサイト一样，而アルト第一个就想到了シェリル的耳坠。马上我方就要出击对付バジュラ了，ランカ一听到后表情立刻变得复杂，她觉得バジュラ似乎并不是那种坏生物。当时她被バジュラ抓住的时候，在バジュラ的体内有一种回家的感觉。バジュラ的脑子很小，似乎不是智能生物，但是ランカ认为脑子小不代表没有心。不过现在没有支持她的证据，我方还是要出手去消灭敌人，但是刹那觉得似乎可以去尝试其他道路。